60份辣椒骨干亲本的SSR遗传多样性分析及指纹图谱构建

雷刚; 陈学军; 周坤华; 黄月琴; 袁欣捷; 李歌歌; 方钰; 方荣; 《植物遗传资源学报 》 2024 北大核心 CSCD

摘要：为解析江西省辣椒育种骨干亲本材料的遗传多样性并构建其DNA指纹图谱，本研究利用毛细管电泳和SSR分子标记技术对江西60份辣椒种质材料进行位点检测。结果表明，49对SSR引物共检测到202个等位基因，平均4.122个，平均有效等位基因为2.172个，平均香农信息指数为0.850，平均多态信息含量为0.414，说明60份供试材料具有较为丰富的遗传多样性；平均期望杂合度0.475大于观测杂合度0.126，表明多代自交导致材料纯合度较高。聚类分析、群体结构分析和主坐标分析结果一致，即江西辣椒育种亲本材料以南方地区和小果型尖椒材料为主，遗传背景狭窄且保持较纯的血统。此外，本研究根据多位点匹配分析确定了PM1、CAMS-855、CO911525S、PM22、Hpms E015和Hpms1214为核心引物，并利用这6对核心引物构建了60份辣椒育种亲本的指纹图谱，为江西辣椒资源的鉴定和保护提供了有力支撑，为分子辅助育种中亲本的选择提供理论依据。

关键词： 辣椒 SSR标记 遗传多样性 指纹图谱 聚类分析 遗传结构分析

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