长雄野生稻地下茎cDNA文库的构建及EST分析

林海妹; 郭安平; 王晓玲; 郭运玲; 孔华; 贺立卡; 《热带作物学报 》 2009 CSCD

摘要：长雄野生稻(Oryza longisatminata)是广泛生长在热带非洲的1个野生种,具有明显的地下茎特征。为了探索控制其地下茎发育的相关基因及其他优异基因,初步构建了地下茎cDNA文库。文库指标显示:初始滴度为2.5×105cfu/μg,扩增滴度为2.9×108cfu/μg,库容为5×106cfu,重组率为82%;随机挑选80个单克隆进行测序,插入片段在400～1000bp之间;对测序结果进行比对分析,获得了58个已报道有一定功能的EST序列,22个未见报道的EST序列;并利用PAUP4.0软件对序列进行了筛选分析。

关键词： 长雄野生稻 地下茎 cDNA文库