科研产出
甘薯PAL基因家族的全基因组鉴定及生物信息学分析
《植物遗传资源学报 》 2025 北大核心 CSCD
摘要：苯丙氨酸解氨酶（PAL, phenylalanin ammonia-lyase）是苯丙烷代谢途径中的关键酶和限速酶，在植物生长发育、抗逆等方面发挥重要作用。本研究在甘薯全基因组中筛选PAL基因家族成员，对甘薯PAL基因家族成员的理化性质、系统进化、保守结构域、染色体定位及基因表达进行了分析。结果表明：在甘薯全基因组中共鉴定出33个PAL成员，不均匀地分布于2、6、9和15号染色体上，PAL蛋白理化性质差异小，保守基序和基因结构相近。IbPAL启动子上存在多个逆境胁迫应答、激素响应和生长发育调控相关的顺式作用元件。甘薯IbPAL与拟南芥、三浅裂野牵牛和三裂叶薯PAL基因存在共线性关系。甘薯转录组数据显示，IbPAL基因在甘薯中的表达存在组织特异性，IbPAL19、IbPAL13、IbPAL7在储藏根的表达量明显高于未分化根和须根。qRT-PCR结果显示IbPAL基因受到干旱和盐胁迫的诱导，在不同胁迫处理下表达模式不同。本研究为进一步探明甘薯PAL家族基因的功能提供了参考，为甘薯遗传改良奠定了基础。
关键词： 甘薯 PAL基因家族 全基因组鉴定 生物信息学分析
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大豆醛酮还原酶超家族的鉴定及表达分析
《农业生物技术学报 》 2022 北大核心 CSCD
摘要：醛酮还原酶(aldo keto reductases,AKRs)广泛分布于动植物中,与外源性和内源性毒素代谢有关,包括应激刺激产生的有毒物质,在类固醇、糖和其他羰基代谢中发挥着重要作用.目前已经在拟南芥(Arabidopsis thaliana)和水稻(Oryza sativa)等植物中报道了一些参与逆境胁迫的AKR基因,但大豆中相关研究仍较少.本研究采用生物信息学方法和qPCR技术对大豆(Glycine max)AKR家族成员进行全基因组鉴定及表达特征分析.在大豆基因组中共鉴定到44个醛酮还原酶GmAKR基因,其编码的蛋白均具有Aldo-ket-red结构域.系统进化分析显示,GmAKR基因可以聚为5个家族,不均匀地分布在大豆的16条染色体上.GmAKR各成员启动子区域均存在数量不等的光响应、激素和逆境响应顺式作用元件,表明该家族基因可能参与大豆的多种生长发育调节过程.基因表达分析结果验证了GmAKR基因在不同组织中的表达模式,与Phytozome数据库收入结果基本一致.本研究为深入揭示大豆AKR家族基因的生物学功能提供了参考.
关键词： 大豆 醛酮还原酶(AKRs) 生物信息学分析 表达模式
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