科研产出
茄子种质遗传多样性及群体结构分析
《种子 》 2023 北大核心 CSCD
摘要：利用18个表型性状和50对SSR分子标记对77份茄子材料进行遗传多样性和群体结构分析。表型多样性分析结果表明，18个表型性状均表现出不同程度的多样性，变异系数变幅为11.47%～78.36%、平均33.58%,其中果形指数变异系数最大，为62.3%,茎表茸毛变异系数最小，为8.2%;香农遗传多样性指数为0.20～2.06、平均1.24,其中果形最高，为2.03,茎表茸毛和叶刺最低，为0.20;主成分分析将18个表型性状概括为果形因子、色泽因子、植株高度因子、果实光滑因子、叶片形态因子、茸毛因子等6个因子，累计贡献率为72.208%,其中果实特征占主要成分；利用组内平方欧氏距离法将供试材料聚为四类群，类群Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ为栽培茄，类群Ⅳ绝大部分为近缘野生茄。50对SSR分子标记引物共扩增出252条带，平均每对标记扩增出5.040条，多态性位点比例（P）为60.057%。利用UPGMA法进行分子聚类，遗传相似系数在0.43～0.94之间，平均值为0.78;在遗传相似系数0.64处，将供试材料划分为6个类群。Structure群体结构分析表明，供试材料被分为6个亚群，其中只有3.89%具有混合来源，绝大部分种质来源单一。表型聚类、UPGMA聚类与Structure群体结构划分的结果相似，均能区分出栽培茄和近缘野生茄，77份茄子种质资源间的类群划分与果实形态和地理来源有一定相关性。
关键词： 茄子 表型性状 SSR分子标记 遗传多样性 群体结构
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辣椒疫病抗性关联分析及优异等位变异挖掘
《植物遗传资源学报 》 2019 北大核心 CSCD
摘要：基于SSR标记技术,对194份辣椒核心种质疫病抗性进行关联分析。58对SSR标记共检测到178个等位变异,Shannon指数平均值为0.6732,多态信息量(PIC)平均值为0.3859,基因多样性平均值为0.4400,说明供试材料具有较高的遗传多样性。群体结构分析将194份材料划分为两个亚群,亚群1的疫病抗性水平高于亚群2。关联分析结果表明,共有12个SSR位点与辣椒疫病病情指数显著关联(P<0.05),表型贡献率为2.98%～16.05%,15个SSR位点与辣椒病株率显著关联,表型贡献率为2.95%～21.29%;表型贡献率最大的位点为CM0005,位于第7号染色体,其余位点分布于第2、3、5、7、8、9和11号染色体,与已有报道有所差异,说明供试种质可能含有新的疫病抗性基因。根据关联位点表型效应值,发掘出CM0005c、ge35-141pmH0135Cd和Hpms1-139c等12个疫病抗性优异等位变异及种质171、55、161、65、132、128、91、106、125、127、169等优良抗性载体材料。本研究结果为辣椒疫病抗性基因发掘和分子标记辅助选择抗性育种提供了理论指导和材料基础。
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辣椒核心种质遗传多样性及群体结构分析
《分子植物育种 》 2019 北大核心 CSCD
摘要：基于SSR标记对200份辣椒核心种质材料进行了遗传多样性及群体结构分析.结果表明,61对SSR引物共扩增出298条多态性条带,平均每对引物检测到4.9条;200份辣椒核心种质的多态信息量(PIC)变幅为0~0.684 8,平均值为0.349 1;香农指数(Shannon-Wiener, I)变幅为0~1.560 6,平均值为0.767 4;基因多样性(Gene diversity)变幅为0~0.728 8,平均值为0.401 7,说明所构建的核心种质具有较为丰富的遗传多样性.采用遗传距离聚类法、群体结构分析法和主坐标分析法对供试材料进行分类,200份核心种质材料分别分成5个类群、3个亚群和2个类群,三种分类结果互相验证,具有较好的一致性.群体结构分析显示,182份供试材料Q≥0.6,说明这些种质材料血缘较纯;另有18份种质Q<0.6,说明其遗传背景相对复杂,具有2个或2个以上亚群的遗传成分,应用这些种质开展辣椒品种改良或杂交配组时,应充分考虑其遗传构成.研究结果为辣椒核心种质的有效利用提供了理论指导.
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水稻苗期抗旱性的关联分析(英文)
《Agricultural Science & Technology 》 2012
摘要：[目的]此研究旨在检测水稻苗期抗旱性的数量性状位点。[方法]通过对 184 份水稻品种的田间苗期抗旱性鉴定,同时利用每 3Mb 为一区间随机分布于水稻 12 条染色体上的 156 个 SSR 标记子对卷叶、枯叶及复水恢复率 3 个苗期抗旱性性状进行标记,通过关联分析检测此 3 个性状的数量性状位点。[结果]水稻品种对苗期干旱具有不同的反应,卷叶、枯叶及复水恢复率这3个性状具有显著的相关性,对该群体在群体结构K=3 和 K=7 时进行了分析。[结果]该组水稻品种存在一定程度的遗传混杂,品种间的相互遗传相关性范围从 0 到 0.924 5。SSR 标记子间存在着明显的连锁不平衡。该试验共检测到与苗期抗旱性关联的16个SSR标记子,其中4个与卷叶性状,8个与枯叶性状,4个于复水恢复率紧密关联,而且大多数的标记子与2个以上的性状关联,表明某个单一抗性机理可能与多个不同性状的表达相关,如:渗透势调节。位于第九染色体上的RM107 标记子与所有 3 个苗期抗旱性性状关联,并且位于以前研究所报道的区间之内,为苗期抗旱性的主要位点,位于第八染色体上的 RM477与复水恢复率显著关联,且与卷叶性状的关联达到极显著水平,该位点可能是苗期抗旱性的另一个主要数量性状位点。[结论]关联分析是用于分析复杂性状(如抗旱性)非常有效的方法。
关键词： 关联作图 苗期抗旱性 卷叶 枯叶 复水恢复率 群体结构
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一组水稻种质资源的遗传相似性及群体结构分析
《江西农业大学学报 》 2012 北大核心 CSCD
摘要：育种的成功基于试验材料中具有可利用的遗传变异,了解种质资源的群体机构及遗传变异范围是作物遗传改良的先决条件。本试验通过利用每3 Mb bin均匀分布于水稻染色体的156个SSR标记子,分析了一组(184个)用于干旱适应性研究的水稻种质资源的遗传相似性及群体结构。结果显示,水稻中确实存在着可供利用的遗传多样性,但也存在着普遍的遗传相似性,如国际水稻所的IR品种及菲律宾国家水稻所的PR及BP水稻品种。通过利用Structure中的混合模型对该184个水稻品种在K=3和K=7时的分析表明,群体结构普遍存在于相同类型或亚种的水稻品种中,籼稻及粳稻品种具有相对明显的群体结构,同一亲本的衍生后代具有显著的遗传相似性和群体结构,不同的群体均存在一定程度的遗传混合。对该组干旱适应性水稻种质资源的遗传相似性及群体结构的研究为今后的抗旱性基因的联合作图,也为合理选择亲本进行水稻抗旱性改良提供了有价值的遗传信息。
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