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资源类型: 中文期刊
关键词:IRAP(模糊匹配)
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江西柿属种质资源遗传多样性的IRAP标记分析

江西农业学报 2017

摘要:利用逆转座子间扩增多态性(Inter-retrotransposon Amplified Polymorphism,IRAP)分子标记对收集的49份江西柿属种质资源进行了遗传多样性分析。从26个IRAP引物中筛选出扩增条带清晰且多态性丰富的10个引物,PCR扩增产物经聚丙烯酰胺凝胶电泳(PAGE)得到清晰的指纹图谱。将418条清晰条带(多态性100%)转换为0/1矩阵,聚类分析结果表明:供试的江西柿属种质资源的遗传相似系数在0.69~0.92之间,分属柿、油柿、野柿三个种,遗传多样性丰富;明晰了几个分类关系模糊的柿种质资源的种属关系。

关键词: 江西 柿属 种质资源 遗传多样性 IRAP

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利用IRAP技术揭示部分柿属种间遗传关系

果树学报 2012 北大核心 CSCD

摘要:【目的】为了明晰柿属植物种间亲缘关系和探究逆转座子与该属植物倍性进化的相关性,【方法】以16种24份柿属植物为试材,利用IRAP(Inter-Retrotransposon Amplified Polymorphism)技术和UPGMA聚类分析。【结果】采自我国南热带的供试基因型独自成组,与其采集地域相吻合,反映了它们较古老的分类学地位;采自我国北亚热带和温带的基因型独立于南亚热带基因型组,含丰富的染色体倍性,且相互间混聚在一起,无明显地域趋同性,反映了该区域基因型间广泛的基因交流和适应性进化;从UPGMA聚类图反映的不同区域柿属基因型间的相对位置来看,逆转座子活性与其倍性进化及生态适应性间存在明显的相关性。【结论】采自我国南亚热带的柿属植物可能更加古老;逆转座子在柿属种间倍性进化过程中可能发挥了一定的作用。

关键词: 柿属植物 遗传关系 IRAP 逆转座子

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逆转座子分子标记及其在果树上的应用

果树学报 2009 北大核心 CSCD

摘要:基于逆转座子特殊的转座机制及其生物学特性发展的逆转座子分子标记,具有多态性高、基因组覆盖度广、适于高通量分析等特点。就常见逆转座子分子标记的原理、操作及其在果树种质鉴定、遗传多样性检测、亲缘关系重建和遗传图谱构建等方面的应用进展进行简要阐述,以期为此类技术在果树上的应用提供参考。

关键词: 果树 IRAP REMAP SSAP RBIP 品种鉴定 遗传多样性 亲缘关系 遗传图谱

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