文献类型： 中文期刊
作者： 宋敏 1 ; 钟晓 1 ; 郑潇潇 2 ; 张炳超 2 ; 王雨文 2 ; 陈伦林 2 ; 李书宇 2 ; 丁戈 2 ; 熊洁 2 ;
作者机构： 1.曲阜师范大学生命科学学院
2.江西省农业科学院作物研究所/国家油料改良中心南昌分中心/农业部长江中下游作物生理生态与耕作重点实验室/江西省油料作物生物学重点实验室
关键词： 甘蓝型油菜;密植;转录组测序;WGCNA
期刊名称： 基因组学与应用生物学
ISSN： 1674-568X
年卷期： 2024 年 43 卷 0Z1 期
页码： 1548-1564
收录情况： 北大核心 ; CSCD
摘要： 合理密植是提高甘蓝型油菜(Brassica napus)产量的重要途径。为探讨油菜对密植的分子响应，本研究以耐密植和不耐密植甘蓝型油菜品种为研究对象，在常规密度和高密度种植条件下对其上位叶和下位叶进行转录组测序。经比较分析，在两品种的上位叶和下位叶样品分别筛选出共有差异表达基因94个和407个，这些基因在两个品种中的表达都随着种植密度不同而表现出差异。通过加权共表达基因网络分析(weighted gene coexpression network analysis, WGCNA)筛选出与耐密植油菜显著正相关的blue和purple模块，对其进行GO富集分析，并从核心基因中筛选出12个核心转录因子(包括EIN3/EIL1、 HD-ZIP、 bHLH、 TCP、 NAC和ERF)和1个蓝光受体基因CRY2。功能注释显示多个核心基因对应的拟南芥(Arabidopsis thaliana)同源基因参与避荫反应。本研究可为甘蓝型油菜耐密植性改良提供数据参考和候选基因资源。
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