您好,欢迎访问江西省农业科学院 机构知识库!

基于SLAF-seq技术鉴定甘蓝型油菜叶缘裂刻性状候选基因

文献类型: 中文期刊

作者: 涂玉琴 1 ; 张洋 1 ; 辛佳佳 1 ; 涂伟凤 1 ; 汤洁 1 ; 戴兴临 1 ;

作者机构: 1.江西省农业科学院作物研究所/农业部作物基因资源与种质创制江西科学观测实验站

关键词: 甘蓝型油菜;叶缘裂刻;SLAF-seq;候选基因

期刊名称: 植物遗传资源学报

ISSN: 1672-1810

年卷期: 2019 年 02 期

页码: 426-435

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 叶缘裂刻性状是甘蓝型油菜遗传育种的理想形态标记。叶缘裂刻性状变异材料的创建对丰富甘蓝型油菜叶片形态和优良品种改良至关重要。本研究以甘蓝型油菜常规品种中双11和甘蓝型油菜叶缘裂刻新品系Y176为亲本(通过甘蓝型油菜与菜远缘杂交获得),从F2群体中分别挑选出叶缘裂刻和正常叶形的植株各50株,构建了两个极端性状混池DNA文库,借助SLAF-seq-BSA技术,挖掘甘蓝型油菜叶缘裂刻性状相关候选基因。共开发出177941个SLAF标签,通过分析SLAF标签的多态性,共获得150168个SNP,其中亲本间共获得128200个SNP。对ED方法和SNP-index方法得到的关联区域进行综合分析,获得1个与目标性状紧密关联的候选区域,位于甘蓝型油菜A10染色体上的14528149~17353693区域,总长度为2.83 Mb,约有666个编码基因。与前人研究定位在同一染色体上,但本研究定位的区间与前人研究不同,说明本研究存在控制叶缘裂刻新基因的可能性大。并对该区域内基因进行功能注释,其中666个注释到NR数据库;517个注释到SwissProt数据库;587个注释到GO数据库;151个注释到KEGG通路;258个注释到COG数据库,对候选基因进行注释有助于进一步分离相关基因。

  • 相关文献

[1]甘蓝型油菜早熟性状QTL定位及候选基因筛选. 李书宇,黄杨,熊洁,丁戈,陈伦林,宋来强. 2021

[2]Genome-Wide SNP Markers Based on SLAF-Seq Uncover Breeding Traces in Rapeseed (Brassica napus L.). Zhou, Qinghong,Zhou, Can,Fan, Shuying,Wu, Caijun,Fu, Donghui,Huang, Yingjin,Zheng, Wei,Mason, Annaliese S.. 2017

[3]鸡精子抗冻性种间差异及其与精浆生化指标和候选基因表达的相关性. 宗云鹤,李云雷,徐松山,倪爱心,袁经纬,麻慧,武艳平,江琳琳,王攀林,石雷,陈超,谢金防,孙研研,陈继兰. 2020

[4]芝麻芽期耐铝胁迫相关性状的QTL鉴定. 梁俊超,赵云燕,王郅琪,孙建,颜廷献,颜小文,饶月亮,周红英,乐美旺. 2022

[5]甘蓝型油菜极早熟种质资源分析及遗传改良. 陈伦林,邹晓芬,李书宇,邹小云,熊洁,张建模,宋来强. 2013

[6]甘蓝型油菜叶缘裂刻性状特征及其遗传分析. 涂玉琴,孙建,戴兴临,汤洁,涂伟凤,邵华强. 2013

[7]甘蓝型油菜小孢子培养胚状体长期保存技术. 李书宇,陈伦林,邹晓芬,熊洁,张建模,宋来强. 2013

[8]不同甘蓝型油菜基因型氮营养效率差异的研究. 邹小云,熊洁,宋来强,邹晓芬,陈伦林,李书宇,官春云. 2015

[9]甘蓝型油菜与蔊菜远缘杂交后代抗旱性鉴定及综合评价. 熊任香,涂伟凤,涂玉琴,汤洁,戴兴临. 2011

[10]除草剂乙草胺胁迫下油菜品种的耐药生理研究. 丁戈,熊洁,陈伦林,李书宇,宋来强. 2022

[11]SSR和SRAP标记揭示甘蓝型油菜遗传多样性的差异分析. 陈伦林,邹小云,李书宇,邹晓芬,张建模,宋来强. 2008

[12]早熟高产优质杂交油菜新品种“赣油杂1009”的选育. 汤洁,戴兴临,涂玉琴,涂伟凤,王丽钦. 2016

[13]不同基因型油菜耐铝性及其根系形态对铝胁迫的响应. 熊洁,丁戈,陈伦林,李书宇,邹小云,黄杨,宋来强. 2021

[14]甘蓝型油菜化学诱导不育系的创制及赣油杂8号的选育. 陈伦林,李书宇,邹小云,邹晓芬,熊洁,张建模,宋来强. 2014

[15]初花期干旱对甘蓝型油菜生理和农艺性状的影响. 熊洁,陈伦林,邹晓芬,邹小云,李书宇,宋来强. 2015

[16]甘蓝型油菜与埃塞俄比亚芥杂交创制有限花序新种质. 涂玉琴,汤洁,张洋,辛佳佳,涂伟凤,姬红利,戴兴临. 2020

[17]基于转录组测序的铝胁迫下甘蓝型油菜新内参基因的发掘与引物开发. 丁戈,黄杨,陈伦林,李书宇,宋来强,熊洁. 2021

[18]一种油菜组织高通量研磨技术及其在甘蓝型油菜镉吸收研究上的应用. 万何平,陈伦林,钱佳丽,沈金雄,傅廷栋. 2019

[19]优质高产油量杂交油菜新品种赣油杂6号的选育. 李书宇,陈伦林,熊洁,邹晓芬,邹小云,宋来强. 2015

[20]甘蓝型油菜与蔊菜远缘杂交选育新品系的主要性状及其硼效应研究. 汤洁,张弢,宋来强,熊任香,邹晓芬,张建模,戴兴临. 2007

作者其他论文 更多>>