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东乡野生稻与日本晴多态性标记的开发

文献类型： 中文期刊

作者： 马小定 1 ; 唐江红 1 ; 张佳妮 1 ; 崔迪 1 ; 李慧 1 ; 黎毛毛 1 ; 韩龙植 1 ;

作者机构： 1.中国农业科学院作物科学研究所/农作物基因资源与基因改良国家重大科学工程;重庆师范大学;江西省农业科学院水稻研究所

关键词： InDel标记;基因组重测序;粳稻

期刊名称： 作物学报

ISSN： 0496-3490

年卷期： 2019 年 02 期

页码： 316-321

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 东乡野生稻是分布于全球最北端的一种普通野生稻,与亚洲栽培稻基因组差异较大,目前缺少覆盖其全基因组的分子标记。本文以东乡野生稻和日本晴为材料,通过筛选已有的1017个标记,并利用东乡野生稻基因组重测序信息设计的217个InDel标记,共检测出203个标记在东乡野生稻与日本晴间呈现多态性。这些标记均匀分布于12条染色体,平均间隔1.9 Mb,基本覆盖东乡野生稻全基因组区域。通过对籼粳亚种的检验分析,发现该套多态性分子标记在东乡野生稻与粳稻杂交后代群体基因型分析上具有较高的应用价值。本研究结果为发掘东乡野生稻的有利基因以及分子标记辅助选择育种提供了有力的工具。

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