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番薯属甘薯与牵牛EST-SSR标记开发及通用性分析

文献类型： 中文期刊

作者： 兰孟焦 1 ; 吴问胜 1 ; 黄水金 1 ; 潘皓 1 ;

作者机构： 1.江西省农业科学院作物研究所

关键词： 甘薯;牵牛;EST-SSR;通用性

期刊名称： 分子植物育种

ISSN： 1672-416X

年卷期： 2015 年 13 卷 12 期

页码： 2761-2766

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 通过对番薯(Ipomoea)属的12 812条甘薯和28 422条牵牛EST唯一序列进行检索分析,在319条甘薯EST序列中发现了共328个EST-SSRs,平均每20.41 kb出现1个甘薯SSR;在936条牵牛EST序列中发现962个EST-SSRs,平均每17.87 kb出现1个SSR;在检索到的甘薯和牵牛EST-SSRs中,二核苷酸重复类型的SSR最多,分别占各自检索总数的44.51%和40.64%。利用SSR-ESTs分别设计了36对甘薯EST-SSR引物和92对牵牛EST-SSR引物,其中有28对甘薯引物在8个甘薯品种中有扩增产物,13对引物扩增产物具有多态性,多态性引物占所设计甘薯引物的36.1%;42对牵牛EST-SSR引物在甘薯基因组中可以扩增出清晰的条带,其中19对有表现较好的多态性,占设计的牵牛EST-SSR引物的20.7%。结果表明,牵牛EST-SSR标记在甘薯上具有通用性,可用于甘薯基因组多样性分析。

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