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转录组和蛋白组联合揭示甜瓜响应涝害胁迫的分子机制

文献类型： 中文期刊

作者： 张焕欣 1 ; 闫承璞 1 ; 李国权 1 ; 张新龙 1 ; 曹娜 1 ; 乐美旺 1 ; 朱方红 1 ; 刘文革 2 ;

作者机构： 1.江西省农业科学院园艺研究所

2.中国农业科学院郑州果树研究所

关键词： 甜瓜;涝害胁迫;转录组;蛋白组

期刊名称： 核农学报

ISSN：

年卷期： 2024 年 004 期

页码： 662-675

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为了探析甜瓜（Cucumis melo L.）响应涝害胁迫的分子机制，采用转录组和蛋白组学方法研究了甜瓜耐涝型材料L45和涝敏感型材料L39在正常培养和涝害胁迫处理条件下的差异表达基因和蛋白。结果表明，L39-W vs L39-C的差异表达基因数为3 532个，差异表达蛋白数为105个；L45-W vs L45-C的差异表达基因数为1 842个，差异表达蛋白数为38个。转录组与蛋白组联合分析发现，L39-W vs L39-C中38个基因在mRNA和蛋白质水平上联合上调表达，12个基因联合下调表达；L45-W vs L45-C中7个基因联合上调表达，3个基因联合下调表达。KEGG显著性富集分析结果发现，L39-W vs L39-C中联合上调表达的基因显著富集在类黄酮生物合成、苯丙烷生物合成、苯丙氨酸代谢、缬氨酸、亮氨酸和异亮氨酸生物合成、精氨酸和脯氨酸代谢等；而L45-W vs L45-C中联合上调表达的基因显著富集在α-亚麻酸代谢、类黄酮生物合成、苯丙烷生物合成、亚油酸代谢等。本研究联合转录组与蛋白组数据进行了差异表达基因与蛋白分析，为进一步挖掘甜瓜响应涝害胁迫的关键基因及通路奠定了一定基础。

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[2]基于RNA-seq的能源植物芒转录组分析. 张贤,王建红,喻曼,曹凯,庄俐,徐昌旭,曹卫东. 2015

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[5]甜瓜Dof家族全基因组鉴定与表达分析. 张焕欣,李国权,杨惠栋,曹娜,朱方红. 2019

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