甘蓝型油菜每角果粒数全基因组关联分析

肖小军; 陈明; 韩德鹏; 余跑兰; 郑伟; 肖国滨; 周庆红; 周会汶; 《生物技术通报 》 2023 北大核心 CSCD

摘要：为挖掘甘蓝型油菜每角果粒数显著关联单核苷酸多态性（SNP）位点及相关候选基因。本研究以300份甘蓝型油菜自交系为试验材料，对甘蓝油菜每角果粒数进行一年两地表型考察，并结合该群体前期开发的201 817个SNPs标记，采用一般线性模型（GLM）和混合线性模型（MLM）进行全基因组关联分析（GWAS），此外，对性状显著关联SNP位点两侧100 kb区域内相关候选基因进行功能预测。300份甘蓝型油菜每角果粒数在两地均表现出广泛的表型变异，筛选出2份每角果粒数较多的油菜种质资源。基于GLM模型检测到39个与油菜每角果粒数显著关联SNPs，采用MLM分析发现，两地共检测到的3个每角果粒数显著关联SNPs位点均在GLM检测到。8个位点附近找到CIK,ERF022和EDE1等19个拟南芥已报道角果籽粒发育相关的同源基因。研究结果有助于解析甘蓝型油菜每角果粒数的遗传基础，为研究每角果粒数的调控机制、指导每角果粒数的遗传改良奠定基础。

关键词： 甘蓝型油菜 全基因组关联分析 每角果粒数 SNP位点 同源基因