转录组和蛋白组联合揭示甜瓜响应涝害胁迫的分子机制

张焕欣; 闫承璞; 李国权; 张新龙; 曹娜; 乐美旺; 朱方红; 刘文革; 《核农学报 》 2024 北大核心 CSCD

摘要：为了探析甜瓜（Cucumis melo L.）响应涝害胁迫的分子机制，采用转录组和蛋白组学方法研究了甜瓜耐涝型材料L45和涝敏感型材料L39在正常培养和涝害胁迫处理条件下的差异表达基因和蛋白。结果表明，L39-W vs L39-C的差异表达基因数为3 532个，差异表达蛋白数为105个；L45-W vs L45-C的差异表达基因数为1 842个，差异表达蛋白数为38个。转录组与蛋白组联合分析发现，L39-W vs L39-C中38个基因在mRNA和蛋白质水平上联合上调表达，12个基因联合下调表达；L45-W vs L45-C中7个基因联合上调表达，3个基因联合下调表达。KEGG显著性富集分析结果发现，L39-W vs L39-C中联合上调表达的基因显著富集在类黄酮生物合成、苯丙烷生物合成、苯丙氨酸代谢、缬氨酸、亮氨酸和异亮氨酸生物合成、精氨酸和脯氨酸代谢等；而L45-W vs L45-C中联合上调表达的基因显著富集在α-亚麻酸代谢、类黄酮生物合成、苯丙烷生物合成、亚油酸代谢等。本研究联合转录组与蛋白组数据进行了差异表达基因与蛋白分析，为进一步挖掘甜瓜响应涝害胁迫的关键基因及通路奠定了一定基础。

关键词： 甜瓜 涝害胁迫 转录组 蛋白组