科研产出
江西地方猪品种的线粒体遗传多样性研究
《江西农业大学学报 》 2013 北大核心 CSCD
摘要:试验对江西8个地方猪种153个个体进行D-1oop高变区测序,获得长度为515 bp的序列进行多态性分析,单倍型多样性值从修水杭猪的0.338±0.120到玉山黑猪的0.819±0.064,碱基多样性从赣中南花猪的0.000 8±0.000 5到玉山黑猪的0.007 9±0.006 6。对所有样本进行分子差异等级分析(AMOVA),品种内的方差组分占62.27%,表明8个猪品种间没有出现显著的遗传分化,品种间表现弱的遗传结构。对153条序列进行网络关系和歧点分布分析表明,整个猪群体曾经历了群体扩张事件。
中国西北6个地方绵羊品种mtDNA的遗传多样性研究
《江西农业大学学报 》 2010 北大核心 CSCD
摘要:基于PCR-SSCP和克隆测序技术,分析了西北6个绵羊品种的群体内和群体间的遗传变异,通过对DNA序列的多重比对,得出A、B、C3种单倍型,在D-loop区内的碱基替换全部为转换;绵羊mtDNA D-Loop区中存在着明显的长度变异,引起变异原因主要是由于1个或几个碱基或串联重复基元序列的插入(或缺失)造成的,不存在绵羊品种特异性;本试验研究的绵羊在各个不同片段中所扩增出的A、B、C3种单倍型基本一致,但不是完全连锁,存在着微小的差异;用NJ法构建了系统进化树,可明显看出中国6个绵羊品种3种单倍型的分类情况,单倍型树表明新疆的巴音布鲁克羊和卡拉库尔羊之间的遗传关系最近。
利用微卫星和线粒体DNA标记研究山羊群体间的遗传关系
《中国农学通报 》 2009 北大核心
摘要:利用微卫星和线粒体DNA分析山羊的遗传多样性及系统进化关系,用25个微卫星位点分析了安哥拉山羊、山东莱芜黑山羊、罕山白绒山羊、太行山羊及乌珠穆沁绒山羊这5个山羊品种的遗传多样性,利用共祖遗传距离的UPGMA聚类表明遗传距离和地理距离是一致的,如内蒙的罕山白绒山羊和乌珠穆沁绒山羊聚到一起。利用线粒体DNA分析安哥拉山羊、山东莱芜黑山羊、鲁北白山羊、太行山羊及乌珠穆沁绒山羊,揭示这5个山羊品种分成A和C2个支系,并进行了群体结构和群体扩张分析。通过比较2种分子标记的分析结果,发现利用微卫星来研究群体的遗传多样性及品种间的关系具有较高的准确性,而线粒体在研究群体系统进化具有一定的优势,在分析品种间关系方面可能不是理想标记。
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