文献类型: 中文期刊
作者: 丁戈 1 ; 黄杨 1 ; 陈伦林 1 ; 李书宇 1 ; 宋来强 1 ; 熊洁 1 ;
作者机构: 1.江西省农业科学院作物研究所国家油料改良中心南昌分中心江西省油料作物生物学重点实验室农业农村部长江中下游作物生理生态与耕作重点实验室
关键词: 甘蓝型油菜;内参基因;转录组测序;实时荧光相对定量PCR;表达稳定性分析;铝胁迫
期刊名称: 华北农学报
ISSN:
年卷期: 2021 年 001 期
页码: 1-9
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 为了研究甘蓝型油菜在铝胁迫条件下内参基因的稳定性,在受到主要铝毒害的根组织内发掘新内参基因,以甘蓝型油菜耐铝品种赣油杂7号和铝敏感品种蓉油18的苗期根组织为研究材料,对营养液培养的试验材料分别设置对照组(0 h)和2个时间梯度(3,24 h)的铝胁迫(100μmol/L AlCl3,pH值4.5)处理组。首先,采用有参考基因组的转录组测序技术(RNA-seq)及FPKM值差异基因表达分析,筛选出符合持家基因特征的5个候选内参基因(Actin7、ARFA1E、SAP5、UXS3、UBC9)。随后,依次进行实时荧光相对定量PCR分析,扩增曲线和熔解曲线分析,LinRegPCR扩增效率分析,geNorm、NormFinder和BestKeeper基因表达稳定性分析,REST 2009相对表达量分析等分析步骤。结果表明,新设计开发的5对候选内参基因引物特异性高。从转录组测序数据中筛选出的4个候选内参基因(Actin7、ARFA1E、SAP5、UXS3)的表达稳定性获得了验证。按表达稳定性的综合排名由高至低排序依次为UXS3、SAP5、ARFA1E、Actin7,其中最优组合为SAP5和UXS3。综上所述,本研究开发的候选内参基因引物特异性高,可以提高铝胁迫试验体系实时荧光相对定量PCR试验的准确性,新发掘的内参基因(Actin7、ARFA1E、SAP5、UXS3),可以作为铝胁迫试验体系实时荧光相对定量PCR试验的新内参基因。
- 相关文献
[1]芝麻根系响应铝胁迫的比较转录组分析. 梁俊超,赵云燕,颜小文,颜廷献,王郅琪,孙建,饶月亮,周红英,乐美旺. 2023
[2]铝胁迫对两个油菜品种生理特性及产量构成因素的影响. 熊洁,丁戈,陈伦林,李书宇,邹小云,宋来强. 2019
[3]铝胁迫对不同耐铝油菜品种苗期生长发育和养分吸收的影响. 熊洁,丁戈,李书宇,陈伦林,宋来强. 2020
[4]芽期Al~(3+)胁迫对芝麻幼苗生长的影响及种质资源耐铝毒性评价. 孙建,乐美旺,饶月亮,颜廷献,颜小文,周红英. 2014
[5]不同浓度铝胁迫对芦笋种子萌发的影响. 叶艳英,张冰冰,汤泳萍,周劲松,罗绍春,尹玉玲. 2022
[6]钙离子与硫化氢互作缓解铝对水稻根系伸长抑制作用的机制. 魏倩倩,徐青山,潘林,孔亚丽,朱练峰,曹小闯,田文昊,刘佳,金千瑜,项兴佳,张均华,朱春权. 2023
[7]芦笋种子萌发期耐铝毒特性综合评价及筛选. 叶艳英,张冰冰,周劲松,汤泳萍,罗绍春,尹玉玲. 2022
[8]芝麻芽期耐铝胁迫相关性状的QTL鉴定. 梁俊超,赵云燕,王郅琪,孙建,颜廷献,颜小文,饶月亮,周红英,乐美旺. 2022
[9]紫云英实时荧光定量PCR分析中内参基因的选择. 张贤,王建红,李增强,曹凯,庄俐,徐昌旭,曹卫东. 2017
[10]基于转录组测序筛选鸡皮肤毛囊性状相关基因和关键通路. . 2023
[11]甘蓝型油菜极早熟种质资源分析及遗传改良. 陈伦林,邹晓芬,李书宇,邹小云,熊洁,张建模,宋来强. 2013
[12]甘蓝型油菜叶缘裂刻性状特征及其遗传分析. 涂玉琴,孙建,戴兴临,汤洁,涂伟凤,邵华强. 2013
[13]甘蓝型油菜小孢子培养胚状体长期保存技术. 李书宇,陈伦林,邹晓芬,熊洁,张建模,宋来强. 2013
[14]不同甘蓝型油菜基因型氮营养效率差异的研究. 邹小云,熊洁,宋来强,邹晓芬,陈伦林,李书宇,官春云. 2015
[15]甘蓝型油菜与埃塞俄比亚芥杂交创制有限花序新种质. 涂玉琴,汤洁,张洋,辛佳佳,涂伟凤,姬红利,戴兴临. 2020
[16]早熟高产优质杂交油菜新品种“赣油杂1009”的选育. 汤洁,戴兴临,涂玉琴,涂伟凤,王丽钦. 2016
[17]基于SLAF-seq技术鉴定甘蓝型油菜叶缘裂刻性状候选基因. 涂玉琴,张洋,辛佳佳,涂伟凤,汤洁,戴兴临. 2019
[18]优质高产油量杂交油菜新品种赣油杂6号的选育. 李书宇,陈伦林,熊洁,邹晓芬,邹小云,宋来强. 2015
[19]甘蓝型油菜(Brassica napus)雄性不育材料的无性保持和繁殖. 宋来强,贺兴文,戴兴临,张建模,孙火喜,熊任香. 1993
[20]利用SRAP标记划分甘蓝型油菜杂种优势群. 邹小云,宋来强,陈伦林,李书宇,邹晓芬,张建模. 2011
作者其他论文 更多>>
-
饲用油菜梯度替代日粮中粗饲料对湖羊生长性能和经济效益的影响
作者:谷志勇;刘宇航;王海波;占今舜;陈伦林;陈新锋;张建斌;霍俊宏
关键词:饲用油菜;湖羊;生长性能;经济效益
-
甘蓝型油菜角果数突变体基因的定位及候选基因分析
作者:赵改会;李书宇;詹杰鹏;李晏斌;师家勤;王新发;王汉中
关键词:油菜;角果数突变体;花芽分化;BSA-seq;RNA-seq
-
除草剂乙草胺胁迫下油菜品种的耐药生理研究
作者:丁戈;熊洁;陈伦林;李书宇;宋来强
关键词:甘蓝型油菜;除草剂;乙草胺;抗氧化
-
植物硒代谢及其影响因素研究进展
作者:熊信果;熊婧;邹小云;黄杨;谷德平
关键词:硒;吸收;转运;代谢;植物
-
甘蓝型油菜早熟性状QTL定位及候选基因筛选
作者:李书宇;黄杨;熊洁;丁戈;陈伦林;宋来强
关键词:甘蓝型油菜;早熟;QTL作图;候选基因
-
早熟、耐迟播油菜新品种赣油105的选育
作者:邹小云;熊信果;黄杨
关键词:油菜;育种;赣油105
-
江西地方花生种质资源主要农艺性状分析与评价
作者:黄杨;熊信果;邹小云;丁戈;谷德平
关键词:花生;种质资源;农艺性状;鉴定评价;江西