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芝麻RSAP-PCR反应体系的正交优化与验证

文献类型: 中文期刊

作者: 孙建 1 ; 颜廷献 2 ; 涂玉琴 3 ; 乐美旺 2 ; 饶月亮 2 ;

作者机构: 1.中国农业科学院油料作物研究所

2.江西省农业科学院作物研究所

3.江西省农业科学院作物研究所国家油料改良中心南昌分中心江西省农业科学院蔬菜花卉研究所江西农业大学农学院

关键词: 芝麻;RSAP;正交优化;体系验证

期刊名称: 基因组学与应用生物学

ISSN: 1674-568X

年卷期: 2015 年 34 卷 10 期

页码: 2200-2209

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 限制性位点扩增多态性(RSAP)是一种新型分子标记技术。为获得适用于芝麻的RSAP-PCR的反应体系,本研究通过L16(45)正交设计与单因素试验相结合的方法,对PCR反应体系中模板DNA、Mg2+、d NTPs、引物和Taq DNA聚合酶等影响因素进行了试验优化。结果表明,芝麻RSAP-PCR的最佳反应体系为:在15μL反应体系中,30 ng模板DNA、2.0 mmol/L的Mg2+、0.3 mmol/L的d NTPs、0.6μmol/L的引物和1.0 U的Taq DNA聚合酶。利用17个芝麻品种对该体系进行了稳定性验证和多态性检测,结果表明,该反应体系稳定、可靠,29对随机引物组合共扩增DNA条带454条,每对引物扩增8~21条,平均15.66条,多态性比例为0%~56.25%,平均25.77%。利用普通芝麻与有限生长习性芝麻构建的F2分离群体对RSAP标记进行了初步遗传验证,结果表明,F2群体植株中出现了亲本位点的分离。该RSAP-PCR反应体系的建立与优化为芝麻遗传多样性分析、连锁图谱构建和分子标记辅助育种提供了新技术。

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