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芝麻MATE基因家族的全基因组鉴定与表达分析

文献类型： 中文期刊

作者： 梁俊超 1 ; 孙建 1 ; 颜廷献 1 ; 乐美旺 1 ; 饶月亮 1 ; 颜小文 1 ; 周红英 1 ;

作者机构： 1.江西省农业科学院作物研究所国家油料改良中心南昌分中心江西省油料作物生物学重点实验室

关键词： 芝麻;MATE基因家族;系统进化分析;保守基序

期刊名称： 基因组学与应用生物学

ISSN：

年卷期： 2021 年 002 期

页码： 735-746

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 植物为了维持其生命系统的正常运转,需要对各种代谢产物和毒素进行转运和排出。多药与毒性化合物排出转运蛋白（multidrug and toxic compound extrusion, MATE）在多种底物和毒素的运输中起到重要作用。本研究利用生物信息学手段对芝麻MATE基因家族进行了全基因组分析,鉴定得到67个MATE基因,分布于全部13条染色体上,亚细胞定位预测表明这些基因主要位于质膜上。串联复制和全基因组复制是芝麻MATE基因家族扩增的主要动力。比较基因组学分析发现在芝麻和拟南芥中具有许多共线性的MATE基因,且大部分串联复制SiMATE基因产生于芝麻和拟南芥分化之后。系统进化分析可将芝麻MATE成员分为4个亚家族,大部分相似功能的已知植物MATE成员被聚在同一分枝中,进化树中关系较近的芝麻MATE成员往往具有相似的基因结构和保守基序。基因表达分析表明一半以上的SiMATE基因具有组织表达特异性。这些结果为芝麻MATE基因功能的研究提供了重要参考。

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