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2013年-2014年江西地区PRRSV分离株NSP2及ORF5基因的遗传变异分析

文献类型： 中文期刊

作者： 李海琴 1 ; 林娟 2 ; 刘垒 3 ; 季华员 1 ;

作者机构： 1.江西省农业科学院畜牧兽医研究所

2.南昌市动物疫病预防控制中心

3.新余市渝水区下镇村农技站

关键词： 猪繁殖与呼吸综合征病毒;ORF5基因;NSP2基因;变异分析

期刊名称： 中国畜牧兽医

ISSN： 1671-7236

年卷期： 2015 年 42 卷 09 期

页码： 2254-2261

收录情况： 北大核心

摘要： 为研究江西地区猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)ORF5基因的变异情况及NSP2基因的结构特征,采用RT-PCR方法扩增了12份江西地区猪场疑似患PRRS的猪肺脏样品中的ORF5全序列和NSP2部分序列,应用DNAStar和Mega 6.0等软件对所得序列进行同源性比对及遗传变异分析。12株PRRSV ORF5核苷酸同源性为83.7%~99.8%,氨基酸同源性为82.1%~99.5%;与参考毒株JXA1、VR-2332和LV的核苷酸同源性分别为84.9%~99.7%、85.2%~91.0%和62.4%~64.8%。对阳性病料进行了NSP2基因部分序列的扩增,测序结果显示12株PRRSV均属于美洲型毒株,12株PRRSV的NSP2部分序列均存在30个氨基酸的不连续缺失,与高致病性PRRSV有相同的缺失特征。12株PRRSV的ORF5遗传进化树分析显示,10株与高致病性PRRSV处在同一进化分支,进一步说明高致病性PRRSV已成为江西地区的优势流行毒株。

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