科研产出
利用高密度SNP芯片分析杭猪的群体遗传结构
《畜牧兽医学报 》 2022 北大核心 CSCD
摘要：旨在更好地了解杭猪保种群体的遗传多样性、亲缘关系和家系结构，有效保护和利用杭猪遗传资源。本研究使用50K SNP芯片对30头杭猪（4头公猪，26头母猪）保种个体进行了单核苷酸多态性（single nucleotide polymorphism, SNP）测定，通过Plink软件对获得的基因型数据进行质控，用于最小等位基因频率、观察杂合度、期望杂合度和多态信息含量的计算，分析杭猪保种群的遗传多样性；使用Plink计算连续性纯合片段（runs of homozygosity, ROH）、构建状态同源（identity by state, IBS）距离矩阵，并计算得到基于连续性纯合片段的近交系数；采用Gmatrix软件构建G矩阵，分析杭猪保种群的亲缘关系；使用Mega X软件构建公猪进化树，分析保种群体的家系结构。结果表明，30头杭猪共得到57 466个SNPs标记，平均检出率为0.988 3±0.000 4,通过质检SNPs数为34 156;平均最小等位基因频率为0.228±0.137,平均多态信息含量为0.255±0.098;平均观察杂合度为0.359±0.181,平均期望杂合度为0.314±0.140。杭猪保种群体平均IBS遗传距离为0.241 7±0.033 6,公猪平均IBS遗传距离为0.178 3±0.025 5;G矩阵分析结果与IBS距离矩阵一致，两个结果均表明杭猪保种群部分个体之间亲缘关系较近。30头杭猪个体共检测到828个ROHs, 83.33%的ROH长度在10 Mb以内，平均长度为（6.96±9.62）Mb,个体ROH平均总长度为（191.95±201.56）Mb。基于ROH的平均近交系数为0.078±0.082,其中公猪平均近交系数为0.219±0.082,说明杭猪保种群整体的近交程度不严重，但公猪存在近交。进化树结果表明，杭猪保种群体目前只有2个家系，其中1个家系包含4头公猪，另一个家系不含公猪。综上所述，杭猪保种场的保种群公猪的血缘数量少，母猪近交程度低，公猪存在近交，需要引入新血统或创建新血统来维持家系结构的平衡以利于杭猪遗传资源的长期保存，防止杭猪遗传多样性的丢失。
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猪ISG15基因表达、多态性及其与繁殖性状的关联分析
《江西农业大学学报 》 2022 北大核心 CSCD
摘要：[目的]明确干扰素刺激基因15(ISG15)在猪不同妊娠时期母胎界面中的表达规律,分析ISG15基因多态位点在中外猪种中的遗传多样性及与繁殖性状的关联性,拟为揭示ISG15基因在猪繁殖功能中发挥的作用提供重要数据.[方法]利用实时荧光定量PCR方法检测ISG15基因在大白猪妊娠15,26,50 d子宫内膜和绒毛膜中的表达水平变化,通过测序比对筛选ISG15基因多态位点,采用PCR-RFLP方法检测多态位点在大白、梅山猪、清平猪、通城猪、大花白猪中的遗传多样性,并利用SPSS19.0分析ISG15基因多态位点与繁殖性状的关联性.[结果]ISG15基因在妊娠26 d子宫内膜和绒毛膜组织中表达水平均显著高于妊娠50 d(P<0.01),并于第二外显子中存在一个NM_001128469.3:c.301A>G同义突变位点.该位点在5个猪品种群体中均处于Hardy-Weinberg平衡状态,但在地方猪种中,c.301A>G位点处于低度多态,以AA基因型为主,而在大白群体中,c.301A>G位点则处于中度多态,以AG基因型为主.进一步进行繁殖性状关联分析,结果显示,在大白经产母猪群体中,AA基因型母猪在总产仔数和产活仔数方面均显著高于AG基因型和GG基因型母猪(P<0.05).[结论]ISG15基因在妊娠早期母胎界面中表达,其c.301A>G位点基因型在中外猪种中呈差异分布,且与产仔数性状显著性相关,暗示ISG15基因可能参与猪产仔数性状的调控.
关键词： 猪 ISG15基因 表达水平 遗传多样性 关联分析
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赣西两头乌猪屠宰测定与肉质检测初报
《江西农业大学学报 》 2021 北大核心 CSCD
摘要：【目的】赣西两头乌猪是江西地方猪品种之一,其生产性能未知,为充分了解赣西两头乌猪的屠宰性能和肉质性状,对其进行屠宰测定和肉质检测,研究结果可以为赣西两头乌猪的保护和利用提供参考依据。【方法】试验对6月龄的12头纯种赣西两头乌猪（公母各半）进行屠宰测定,分析胴体质量和屠宰率等屠宰性能、眼肌面积和瘦肉率等胴体性状以及大理石纹和剪切力等肉品质,并检测肌肉中氨基酸和脂肪酸含量。【结果】赣西两头乌猪平均屠宰率公、母猪分别为70.41%、70.64%;平均膘厚为公猪3.31 cm、母猪4.05 cm,且公猪平均膘厚极显著小于母猪（P<0.01）;眼肌面积为公猪24.8 cm2、母猪23.69 cm2;瘦肉率为公猪42.95%、母猪42.42%;脂肪率为公猪34.92%、母猪35.01%;皮率为公猪12.93%、母猪13.14%;骨率为公猪9.21%、母猪9.43%;熟肉率为公猪62.93%、母猪64.38%;失水率为公猪8.61%、母猪8.21%;贮存损失为公猪4.97%、母猪6.18%,且公猪贮存损失显著低于母猪（P<0.05）;赣西两头乌猪肌肉化学成分为蛋白质平均含量20.80%、脂肪平均含量3.60%、水分平均含量73.67%。屠宰率、眼肌面积、瘦肉率、脂肪率、皮率、骨率、熟肉率、失水率等性状不存在性别差异。在肌肉氨基酸含量中,组氨酸含量比乐安花猪和东乡花猪要高。在不饱和脂肪酸中棕榈油酸平均含量为2.59%,十七碳烯酸平均含量为0.15%,油酸平均含量为43.58%,亚油酸平均含量为7.05%,亚麻酸平均含量为0.28%,二十碳烯酸平均含量为1.11%,二十碳二烯酸平均含量为0.38%,二十碳三烯酸平均含量为0.13%,花生四烯酸平均含量为0.32%。【结论】赣西两头乌猪具有较高屠宰率,公猪肉的系水力强于母猪,较不容易形成酸肉,肌肉中具有较高的组氨酸和花生四烯酸,是优良的地方猪种。
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DIRAS3基因在猪子宫内膜组织中的表达及其对胚胎附植数的影响
《黑龙江畜牧兽医 》 2021 北大核心
摘要：为了探讨DIRAS3基因在附植期猪子宫内膜组织中的表达情况及其对胚胎附植数的影响,试验采用实时荧光定量PCR和免疫组织化学方法分析了DIRAS3基因在妊娠第15,26,50天大白猪子宫内膜组织中的表达和定位情况,并通过小鼠腹腔注射试验检测DIRAS3基因对胚胎附植数的影响。结果表明:妊娠第15天大白猪子宫内膜组织中DIRAS3基因的相对表达量极显著高于妊娠第26,50天（P<0.01）,且阳性信号主要集中在子宫内膜腔上皮细胞中,在子宫腺体上皮细胞中有零星分布;而在妊娠第26,50天中,子宫内膜腔上皮细胞中均未观察到明显阳性信号,仅在子宫腺体上皮细胞中存在零星分布。小鼠腹腔注射DIRAS3单克隆抗体后,小鼠胚胎附植数显著减少（P<0.05）。说明妊娠过程中DIRAS3基因在附植期子宫内膜中呈现高水平表达,且可能参与胚胎附植过程的调控。
关键词： 猪 DIRAS3基因 子宫内膜 附植期 胚胎附植数
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麦洼牦牛和西门塔尔牛肉营养品质与感官特性的比较研究
《畜牧与兽医 》 2021 北大核心
摘要：为探索"北牛南运"这一模式对牦牛肉营养品质和感官品质的影响,以麦洼牦牛为研究对象,将体重相近的麦洼牦牛和西门塔尔牛经30 d短期饲喂后,对感官指标、营养成分以及食味品质进行分析比较。结果表明,与西门塔尔牛肉相比,麦洼牦牛肉的水分含量较低（P<0.05）,蛋白质含量和氨基酸总量较高（P<0.05）,脂肪含量和胆固醇含量均较低（P<0.05）,麦洼牦牛肉的鲜味氨基酸谷氨酸以及肌苷酸的含量均显著高于西门塔尔牛肉（P<0.05）,而且其肉色深红。麦洼牦牛肉在"北牛南运"的模式下,其肉质的营养品质和感官特性都得到了很好的保留,是作为特色牛肉和高档牛肉发展的一个很好方向,研究结果将为南方地区发展牦牛就地生产、就近销售以及特色化牛肉生产方面提供科学参考。
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猪USP18基因表达规律及其与产仔数性状 的关联分析
《南方农业学报 》 2020 北大核心 CSCD
摘要：[目的]明确泛素特异性蛋白酶18基因(USP18)在猪不同妊娠时期子宫内膜中的表达规律及其与雌激素和孕激素的关系,并分析其多态性与产仔数性状的关联性,为揭示USP18基因在猪妊娠过程中的作用机理提供参考依据.[方法]PCR扩增猪USP18基因编码区(CDS)序列及开展相关生物信息学分析,利用实时荧光定量PCR检测USP18基因在梅山猪和大白猪妊娠15、26和50 d子宫内膜中的表达水平,通过体外细胞试验检测分析雌二醇和孕酮联合处理对子宫内膜上皮细胞USP18基因表达的影响,并采用PCR-RFLP和SPSS 19.0检测猪USP18基因多态性与产仔数性状的关联性.[结果]猪USP18基因CDS序列为966 bp,共编码322个氨基酸残基,编码蛋白分子量为37 kD,理论等电点(pI)为6.74;猪USP18氨基酸序列与牛USP18氨基酸序列的同源性为82%,二者的遗传距离最近.USP18基因在妊娠15和26 d梅山猪和大白猪子宫内膜中的相对表达量均明显高于妊娠50 d,且在妊娠26和50 d,USP18基因在梅山猪子宫内膜组织中的相对表达量显著高于在大白猪子宫内膜组织中的相对表达量(P<0.05,下同).以10-10 mol/L雌二醇和10-8 mol/L孕酮联合处理子宫内膜上皮细胞,USP18基因在子宫内膜上皮细胞中的相对表达量呈上调趋势,且显著高于激素处理前的相对表达量.在猪USP18基因CDS序列953 bp处存在1个SNP位点(T/G错义突变),其不同基因型与产仔数性状的关联分析结果表明,在经产母猪中,TG基因型母猪产活仔数最多,GG基因型母猪产活仔数最少,且差异显著.[结论]猪USP18基因在附植期子宫内膜中高水平表达,且在子宫内膜上皮细胞中的表达受雌激素和孕激素诱导,表明USP18基因在妊娠早期建立过程中发挥着重要作用.USP18基因在梅山猪和大白猪间的差异表达可能是导致梅山猪产仔数高于大白猪的一个重要因素.
关键词： 猪 USP18基因 子宫内膜 上皮细胞 妊娠 激素
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白术对猪O型口蹄疫疫苗免疫效果及抗氧化性的影响
《猪业科学 》 2019
摘要：为提高猪O型口蹄疫疫苗的免疫效果,将试验猪分为5组,在免疫口蹄疫疫苗前分别饲喂基础日粮、添加了0.5%粉碎白术、1.0%粉碎白术、0.5%煎煮白术、1.0%煎煮白术的试验日粮,然后对各组猪进行口蹄疫的常规免疫,首免前和二免后3周后分别采血测定口蹄疫抗体水平.结果表明,首免前各试验组猪与对照组相比,除饲喂1.0%粉碎白术组外,口蹄疫抗体水平与对照组相比差异均不显著(P> 0.05),且低于试剂盒0.4的阳性标准,二免后3周的测定结果表明,0.5%水平的粉碎白术和0.5%煎煮白术均较对照组显著提高了口蹄疫的抗体水平(P <0.05),试验中未见明显不良反应,对试验猪体增重的影响也不大;此外,首免前饲喂1.0%粉碎白术组的抗体水平均值为0.409,高于试剂盒0.4的阳性标准,且显著高于对照组(P<0.05),二免后3周该组的均值为0.384,低于试剂盒0.4的阳性标准,与对照组差异不显著(P>0.05).总之,0.5%的煎煮或粉碎白术添加到基础日粮饲喂10 d,可显著提高O型口蹄疫疫苗二免后3周的口蹄疫抗体水平,生产中母源抗体对口蹄疫疫苗免疫失败的影响也值得重视.
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基于物联网技术的生猪存亡远程监测系统设计与验证
《中国农业科学 》 2017 北大核心 CSCD
摘要：【目的】当前政府对生猪的监管停留在标签式耳标的被动监管上,但由于监管滞后经常出现死猪被丢弃的恶性事件发生,为了解决监管部门对生猪存亡状态远程监管难的问题,同时便于养殖企业监测生猪的心率,对异常心率的生猪及时采取有效措施。笔者设计一种集生猪心率采集及生猪存亡判断的远程监测系统。【方法】系统采用无线传感网的数据传输架构模式,由智能耳标、路由节点、网关、远程服务器、猪场监测中心、政府监管部门监测中心组成。智能耳标采集数据通过无线Zig Bee网络经路由节点,由网关中的GPRS模块将数据经由Internet转发至远程服务器中,软件系统自动对数据异常生猪报警。参考人用穿戴式心率监测的设计,采用光电心率测量法,使用LED及光感应器,结合滤波电路、放大电路设计了心率传感器。同时为确定LED的发光波长及光感应器的感应波长,通过采集不同体重杜长大猪耳处血液样本,运用郎伯比尔定律,利用分光光度计研究生猪血液中(Hb O2)与脱氧血红蛋白(Hb)对光谱吸光度规律,从光电心率测量法的原理出发,分析心率传感器在运动状态下测量不精确的原因。此外结合生猪的睡眠习性利用姿态传感器MPU6050中的DMP(Digital Motion Processor)获取稳定的姿态数据,并识别心率传感器采集的不准确的数据。最后采用具有Zig Bee协议的CC2530通过自带的ADC转换器、I/O模拟IIC通信协议实现心率传感器、MPU6050的数据读取,并通过Zig Bee网络进行数据传输,用其PM2(睡眠)模式降低功耗,制成集心率与姿态的监测为一体的耳标佩戴在猪耳上。【结果】研究表明从Hb O2与Hb对光谱吸光度规律观测,同时考虑到电子元件的成本、通用率,对生猪生活影响等因素,560 nm光用于生猪光电式心率测量效果明显。生猪心率传感器采用该波长光对生猪心率测量与传统人工测量方法对比,心率误差为0.9%,由于生猪卧睡时间占75%以上并且基本只在进食前后活动,因此心率传感器可较长时间对生猪进行监测,尤其是利用MPU6050监测运动情况,故该系统可实现对生猪静态下进行心率监测、动态下进行姿态监测,当在静态下无心率数据则代表生猪死亡。【结论】由于该耳标质量轻、体积小、功耗低、测量准确,可以较为便利地实现在静态下对生猪进行心率监测和动态下的姿态监测,即实现了生猪存亡状态监测的同时,也实现了对生猪心率的长期监测。改变了传统RFID耳标的被动监测模式,对改善生猪的福利水平及提高政府的监管能力具有重要意义。
