科研产出
芝麻芽期耐铝胁迫相关性状的QTL鉴定
《华北农学报 》 2022 北大核心 CSCD
摘要：为解析芝麻耐铝毒遗传机制，发掘和定位芝麻耐铝毒QTL,采用不同浓度铝离子对地方品种金黄麻和竹山白进行了芽期胁迫处理，确定芽期铝胁迫处理适宜浓度。利用耐铝毒芝麻种质金黄麻和铝敏感芝麻种质竹山白为亲本构建的一个含有180个家系的重组自交系群体，以铝胁迫下芝麻芽期相对根长（RRL）、相对芽长（RSL）和相对苗鲜质量（RSW）作为表型指标，结合通过重测序构建的一个含有1 354个bin标记的高密度遗传图谱，采用复合区间作图法，对芝麻芽期耐铝毒性状进行了QTL定位和候选基因筛选。3个性状在群体中呈显著正相关，共检测到7个QTL,分布于6条染色体上（2,4,6,10,11,13号染色体）,其中3个与相对根长相关，2个与相对芽长相关，2个与相对苗鲜质量有关。其中位于2号染色体的2个分别控制相对根长和相对苗鲜质量的QTL区间部分重叠。候选基因分析的结果表明，15个预测基因可能与耐铝胁迫相关，主要参与金属转运、脱毒和金属离子的跨膜结合、GDSL基序酯酶、过氧化物酶体以及生物体内有毒物质的代谢与解毒等生理进程。
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甘蓝型油菜早熟性状QTL定位及候选基因筛选
《作物学报 》 2021 北大核心 CSCD
摘要：目前对于油菜早熟的研究主要围绕开花期性状进行,虽然开花期与生育期呈显著正相关,但却并不完全一致.对于油菜开花后一系列生长发育进程相关性状的遗传研究和QTL定位鲜有报道.本研究以成熟期差异较大的2个油菜品种'花前早'和'Global'构建的DH群体为材料,对影响油菜全生育期的各个发育阶段(开花期、花期持续时间、角果期持续时间和全生育期等)进行表型调查和QTL定位分析.共检测到30个早熟相关性状QTL位点,其中开花期、花期持续时间、角果期持续时间和全生育期等分别检测到12、5、4和9个QTL位点,解释了5.8%~22.4%的表型方差.发现4、2和1个全生育期QTL置信区间分别与开花期、花期持续时间、角果期持续时间位点置信区间完全或部分重叠.筛选到29个可能与油菜早熟性状相关的候选基因,它们通过调控花期或籽粒发育等生长发育进程影响油菜早熟.因此,在早熟性状的研究中,可以同时从开花期和籽粒发育过程入手,不但有利于使熟期进一步提前,也可减缓早熟油菜品种过早开花导致的冬前低温寒潮天气的不利影响.
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鸡精子抗冻性种间差异及其与精浆生化指标和候选基因表达的相关性
《中国家禽 》 2020 北大核心
摘要：为探究公鸡精子抗冻性的品种变异情况及抗冻性调控机制,以洛岛红、白来航和北京油鸡公鸡为材料,每个品种24只鸡,对比品种间精子抗冻性差异,以及精子抗冻性与精浆生化指标和相关候选基因表达量的相关性.结果表明,冷冻后北京油鸡的精子活力下降了22.44%,其他两个品种下降40%以上.三个品种的冷冻后精子活力变异系数有不同程度升高,其中洛岛红的最大.冷冻后三个品种的精子曲线速率(VCL)均下降、直线性(LIN)均提高,洛岛红精子直线速率(VSL)提高,白来航和北京油鸡精子VSL降低.冷冻精液的平均受精率依次为北京油鸡(72.31%)>白来航(60.64%)>洛岛红(59.99%).北京油鸡冻精单天最高和最低的受精率分别为88.89%和61.11%,白来航分别为75.00%和46.88%,洛岛红分别为71.88%和44.12%.三个品种冷冻精液的受精蛋孵化率和健雏率分别超过90%和99%,且与鲜精无显著差异(P>0.05).北京油鸡精子抗冻性与鲜精精子活力、精浆中丙二醇(MDA)、超氧化物歧化酶(SOD)和果糖含量无显著相关性(P>0.05);精子抗冻性与CIRBP表达呈显著负相关(r=-0.45,P=0.04),与HSP90表达存在正相关趋势(r=O.36,P=0.08),与HSP70、TEKT4、TEKT5和PRKCA基因表达之间无显著相关(P>0.05).综上所述,不同品种、不同个体公鸡的精液抗冻性存在差异,鲜精精子活力、精浆中MDA、SOD和果糖含量与精子抗冻性无显著相关,不能作为判断精子抗冻性的指标.睾丸HSP90和CIRBP等基因的表达可能会影响鸡精子抗冻性,具体机制还需要进一步探究.
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基于SLAF-seq技术鉴定甘蓝型油菜叶缘裂刻性状候选基因
《植物遗传资源学报 》 2019 北大核心 CSCD
摘要：叶缘裂刻性状是甘蓝型油菜遗传育种的理想形态标记。叶缘裂刻性状变异材料的创建对丰富甘蓝型油菜叶片形态和优良品种改良至关重要。本研究以甘蓝型油菜常规品种中双11和甘蓝型油菜叶缘裂刻新品系Y176为亲本(通过甘蓝型油菜与菜远缘杂交获得),从F2群体中分别挑选出叶缘裂刻和正常叶形的植株各50株,构建了两个极端性状混池DNA文库,借助SLAF-seq-BSA技术,挖掘甘蓝型油菜叶缘裂刻性状相关候选基因。共开发出177941个SLAF标签,通过分析SLAF标签的多态性,共获得150168个SNP,其中亲本间共获得128200个SNP。对ED方法和SNP-index方法得到的关联区域进行综合分析,获得1个与目标性状紧密关联的候选区域,位于甘蓝型油菜A10染色体上的14528149～17353693区域,总长度为2.83 Mb,约有666个编码基因。与前人研究定位在同一染色体上,但本研究定位的区间与前人研究不同,说明本研究存在控制叶缘裂刻新基因的可能性大。并对该区域内基因进行功能注释,其中666个注释到NR数据库;517个注释到SwissProt数据库;587个注释到GO数据库;151个注释到KEGG通路;258个注释到COG数据库,对候选基因进行注释有助于进一步分离相关基因。
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