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转录组测序(RNA-seq)策略及其数据在分子标记开发上的应用

文献类型： 中文期刊

作者： 李小白 1 ; 向林 1 ; 罗洁 1 ; 胡标林 2 ; 田胜平 1 ; 谢鸣 1 ; 孙崇波 1 ;

作者机构： 1.浙江省农业科学院

2.江西省农业科学院

关键词： 转录组;二代测序;分子标记;比较作图

期刊名称： 中国细胞生物学学报

ISSN： 1674-7666

年卷期： 2013 年 35 卷 005 期

页码：

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 新一代测序技术已经广泛应用于转录组的研究(即RNA-seq),其数据几乎涵盖了特定组织和特定时期的所有转录本.由于其高通量和低成本的优势,RNA-seq越来越受到研究者的青睐,特别是在那些缺乏基因组信息的物种上.在此综述中,讨论了RNA-seq的测序策略,包括物种遗传背景的考量,测序平台和数据拼接软件的选择.RNA-seq数据对于SSR和SNP等分子标记的开发是非常有用的,由于这些标记在相关物种中有很高的通用性,因此在比较作图中有其不可替代的优势.

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