文献类型： 中文期刊

作者： 周会汶 ¹ ; 吴兰花 ¹ ; 韩德鹏 ² ; 郑伟 ² ; 余跑兰 ² ; 吴杨 ¹ ; 肖小军 ² ;

作者机构： 1.九江学院江西油茶研究中心药学与生命科学学院

2.江西省红壤及种质资源研究所国家红壤改良工程技术研究中心江西省红壤耕地保育重点实验室

关键词： 甘蓝型油菜;硫苷;全基因组关联分析;MYB转录因子;硫苷转运蛋白2

期刊名称： 生物技术通报

ISSN： 1002-5464

年卷期： 2024 年 40 卷 001 期

页码： 222-230

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： [目的]挖掘与种子硫苷含量显著关联的SNP位点及候选基因,有助于油菜品质改良和培育高品质油菜品种.[方法]以 300 份甘蓝型油菜自交系为材料,考察了江西农业大学试验地和江西省红壤及种质资源研究所试验地2 种环境下种子硫苷含量,采用前期开发的 201 817 个SNP(single nucleotide polymorphism,SNP)标记对油菜种子硫苷含量进行全基因组关联分析(genome-wide association study,GWAS),搜寻显著位点两侧 100 kb范围内的候选基因并进行功能注释.[结果]300 份甘蓝型油菜种子硫苷含量在两地均表现出表型差异;基于一般线性模型和混合线性模型检测到 209 个硫苷含量显著关联SNP位点,其中两地两种方法重复检测到 41 个SNP位点,分别在A05(1 个)、A09(36 个)、C09(4 个)3 条染色体上.候选基因功能注释结果显示,有 8 个候选基因参与硫苷生物合成途径(GO:0019761),包含调控硫苷合成相关基因MYB28(BnaC09g05290D、BnaC09g05300D)、MYB34(BnaA09g05480D)和编码硫苷转运蛋白 2 相关基因(BnaA09g06180D、BnaA09g06190D).[结论]通过两种方法在两地检测到多个与硫苷显著关联的SNP位点,并在显著性位点附近挖掘到相关候选基因,研究结果有助于解析甘蓝型油菜硫苷含量的遗传变异,为低硫苷含量油菜新品种的遗传改良提供基础.