文献类型： 中文期刊
作者： 谢红卫 1 ; 钱明娟 2 ; 潘境涛 3 ; 袁林峰 4 ; 蔡怡聪 5 ;
作者机构： 1.中国水稻研究所
2.江西省超级水稻研究发展中心/国家水稻工程实验室(南昌)中国水稻研究所南昌大学生命科学学院
3.南昌大学生命科学学院江西省分子生物学与基因工程重点实验室江西省超级水稻研究发展中心
4.江西省超级水稻研究发展中心/水稻国家工程实验室(南昌)南昌大学中国水稻研究所
5.江西省超级水稻研究发展中心水稻国家工程实验室江西省烟草公司
关键词： 线粒体特异序列;细胞质;分子标记;水稻
期刊名称： 基因组学与应用生物学
ISSN： 1674-568X
年卷期： 2016 年 35 卷 10 期
页码： 2775-2780
收录情况： 北大核心 ; CSCD
摘要： 为了开发一套用于水稻细胞质多态性鉴定的分子标记,本研究通过对已测序的4个水稻线粒体基因组CW-CMS、LD-CMS、Nipponbare和9311线粒体基因组进行比较分析,获得55个大于100 bp的线粒体特异序列,并开发出一套水稻线粒体特异序列分子标记。该套分子标记稳定可靠,在对随机选择的23个水稻品种的线粒体组型鉴定中,共有24个线粒体特异标记扩增出多态性,使用UPGMA法聚类分析,在相似系数为0.46,可以将23水稻品种分为2大类群,其中第一大群可分为两个小类群,类群Ⅰ为粳稻聚类群,该类群大部分为粳稻品种,同时也有2个籼稻品种,推测这两个品种细胞质来源于粳稻;类群Ⅱ包含两个籼稻品种,与粳稻的细胞质亲缘关系较近;而第二大聚类群全部为籼稻品种,大部分品种间多态性丰富。因此,该套水稻线粒体特异序列标记可用于水稻细胞质多态性鉴定分析,同时该类型分子标记的开发对于其他物种的细胞质多态性鉴定具有指导意义。
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