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辣椒土传病原菌三重PCR检测体系的建立与应用

南方农业学报 2022 北大核心 CSCD

摘要:【目的】建立简便、快速、准确同时检测辣椒疫霉(Phytophthora capsici)、白绢病菌(Sclerotium rolfsii)和青枯病菌(Ralstonia solanacearum)的多重PCR检测体系,为辣椒多种土传病害同时早期诊断提供技术支撑。【方法】以3种辣椒土传病害病原菌辣椒疫霉、白绢病菌和青枯病菌为研究对象,参考相关文献筛选出3种病原菌的3对特异性引物PCA1F/PCA1R、SCR-F/SCR-R和RalfliC-F/RalfliC-R,以引物浓度、退火温度、循环次数及延伸时间为变异因子,探索最佳反应体系,建立三重PCR检测方法,并基于田间实际发病样品对方法进行验证。【结果】优化的三重PCR反应体系25.0μL:3对引物PCA1F/PCA1R、SCR-F/SCR-R和RalfliC-F/RalfliC-R浓度分别为0.24、0.24和0.28μmol/L,DNA模板各10 ng,2×Multiplex PCR Mix 12.5μL,ddH2O补足至25.0μL。最佳扩增程序:94℃预变性1 min;94℃30 s,55.8℃30 s,72℃45 s,进行35个循环;72℃延伸10 min。建立的三重PCR体系可分别扩增出352、540和724 bp的特异性目的片段,体系灵敏度达10-1ng/μL。利用建立的反应体系,对来自江西省不同市(县)的54份辣椒和土壤样品进行检测,样品检出率为100%。【结论】建立的三重PCR检测体系可对辣椒田间发病植株和土壤中辣椒疫霉、白绢病菌和青枯病菌进行快速、准确检测,可应用于辣椒多种土传病害并发的早期预防和流行监测。

关键词: 辣椒 三重PCR 辣椒疫霉 白绢病菌 青枯病菌

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大豆醛酮还原酶超家族的鉴定及表达分析

农业生物技术学报 2022 北大核心 CSCD

摘要:醛酮还原酶(aldo keto reductases,AKRs)广泛分布于动植物中,与外源性和内源性毒素代谢有关,包括应激刺激产生的有毒物质,在类固醇、糖和其他羰基代谢中发挥着重要作用.目前已经在拟南芥(Arabidopsis thaliana)和水稻(Oryza sativa)等植物中报道了一些参与逆境胁迫的AKR基因,但大豆中相关研究仍较少.本研究采用生物信息学方法和qPCR技术对大豆(Glycine max)AKR家族成员进行全基因组鉴定及表达特征分析.在大豆基因组中共鉴定到44个醛酮还原酶GmAKR基因,其编码的蛋白均具有Aldo-ket-red结构域.系统进化分析显示,GmAKR基因可以聚为5个家族,不均匀地分布在大豆的16条染色体上.GmAKR各成员启动子区域均存在数量不等的光响应、激素和逆境响应顺式作用元件,表明该家族基因可能参与大豆的多种生长发育调节过程.基因表达分析结果验证了GmAKR基因在不同组织中的表达模式,与Phytozome数据库收入结果基本一致.本研究为深入揭示大豆AKR家族基因的生物学功能提供了参考.

关键词: 大豆 醛酮还原酶(AKRs) 生物信息学分析 表达模式

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木聚糖酶生产菌Saccharothrix variisporea YJ的筛选、发酵条件及酶学性质研究

微生物学杂志 2022 CSCD

摘要:以Azo-xylan为底物,利用双层平板法从堆肥中筛选到可降解木聚糖的菌株,16S rRNA测序分析显示该菌株与糖丝菌属(Saccharothrix variisporea)的同源性最高(99.33%),命名为S.variisporea YJ。研究发现以酵母提取物或(NH42SO4作为氮源、甘蔗叶作为碳源、初始pH值7.0、发酵温度40℃、发酵时间5 d时,发酵液中木聚糖酶的酶活性最高。酶学性质研究表明该木聚糖酶的最适反应温度及pH值分别为55℃和8.0,在55℃以下及pH值4.0~10.0的范围内保持较高稳定性。Na+能有效提高木聚糖酶活性,Mg2+和Mn2+没有明显影响,Cu2+则严重抑制木聚糖酶活性。此外,发酵液还可以直接对天然底物玉米芯进行降解。

关键词: 木聚糖酶 Saccharothrix variisporea YJ Azo-xylan 双层平板 优化 性质

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辣椒新品种'赣椒18号'

园艺学报 2022 北大核心 CSCD

摘要:‘赣椒18号’辣椒是以不育系C002A7为母本,恢复系WY119为父本配制而成的一代杂种。果实羊角形,味辣,青熟果深绿色,生物学成熟果红色;果长26.0 cm,果肩宽1.4 cm,果肉厚0.22 cm,单果质量18.70 g;早中熟,抗疫病,平均产量40.0~50.0 t·hm-2。适宜于长江流域地区及气候类型相似地区春促早和秋延后大棚栽培。

关键词: 辣椒 品种

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日粮中添加芦丁对湖羊瘤胃细菌菌群多样性及其组成的影响

福建农业学报 2022 CSCD

摘要:【目的】研究日粮中添加芦丁对湖羊瘤胃细菌菌群多样性及组成的影响。【方法】选择3月龄左右、健康且体重相近的湖羊36只,随机分为3个处理,每个处理12只(公母各半,分栏饲养)。对照组(CON组)饲喂基础日粮,试验组R50和R100分别在基础日粮中添加50、100 mg·kg-1(湖羊体重基础)的芦丁。试验期为70 d,预试期14 d,正试期56 d。【结果】1)3组共产生446个OTUs(Operational taxonomic units),其中共有OTU为396个,占总OTU的88.79%,所有样品共注释了14个门(Phylum)、18个纲(Class)、21个目(Order)、34个科(Family)和99个属(Genus)。2)相对于CON组,R100组的ACE指数、Shannon指数、Chao1指数显著降低(P<0.05)。但CON和R50组中Alpha多样性均无显著差异(P> 0.05)。3)通过PCoA分析(Principal co-ordinates analysis)、NMDS分析(Non-metricmulti-dimensionalscalinganalysis)、 UPGMA聚类方法(Unweightedpairgroupmethodwith arithmetic mean clustering analysis)和Anosim分析可知,R100组显著影响微生物群落结构。4)在门水平,拟杆菌门(Bacteroidetes)和厚壁菌门(Firmicutes)为两大优势菌门。相比CON组,R100组髌骨细菌门(Patescibacteria)的相对丰度显著提高,迷踪菌门(Elusimicrobia)的相对丰度显著降低(P<0.05),但R50组Elusimicrobia的相对丰度显著高于CON组和R100组(P<0.05)。5)在属水平,优势菌属均为普雷沃菌属_1(Prevotella_1)。在已鉴定丰度排名前30的属水平上,R100组新月形单胞菌属_1(Selenomonas_1)和琥珀酸菌属(Succiniclasticum)的相对丰度显著低于CON组(P<0.05),但与R50组差异不显著(P>0.05)。【结论】添加100 mg·kg-1的芦丁能够影响湖羊瘤胃微生物多样性。

关键词: 湖羊 芦丁 瘤胃 微生物

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强冷空气过程中3种柑橘光合生理特性的变化及抗寒性综合评价

果树学报 2022 北大核心 CSCD

摘要:【目的】探明一次强冷空气过程对柑橘植株生长影响的生理机制,并以此进行品种间抗寒性评价。【方法】以江西地方特色柑橘品种南丰蜜橘(Citrus reticulata ‘Nanfengmiju’)、金沙柚(C.grandis ‘Jinshayou’)和纽荷尔脐橙(C.sinensis ‘Newhall Navel Orange’)为试材,研究强冷空气过程对3个柑橘品种叶片的叶绿素含量、光合荧光特性、活性氧物质含量和抗氧化酶活性的影响,并对上述生理参数进行主成分分析,最终确定3个柑橘品种的抗寒性强弱。【结果】强冷空气过程初期,随着空气温度的降低,3个柑橘品种的叶绿素含量(Chla和Chlb)、最大光合速率(Pmax)、表观量子效率(AQY)、PSII原初光能转化效率(Fv/Fm)和光饱和点(LSP)均呈现下降趋势,在气温回升期间,叶绿素含量、Pmax、AQY、Fv/Fm和LSP的值随温度的回升而增加,整个强冷空气过程中南丰蜜橘的值均最大;3个柑橘过氧化氢(H2O2)和丙二醛(MDA)含量在整个强冷空气过程中,表现为先上升后降低的趋势,且H2O2和MDA含量的平均值以纽荷尔脐橙最大,金沙柚次之,南丰蜜橘最小;抗氧化化酶(SOD和POD)的活性在整个降温和升温过程中也呈现先上升后降低的趋势,但整体活性仍处在较高水平,且SOD和POD活性的平均值南丰蜜橘最小,纽荷尔脐橙最大。【结论】空气温度的骤然降低是柑橘生理生化参数变化的主要原因,3个柑橘品种的抗寒性强弱依次为南丰蜜橘>金沙柚>纽荷尔脐橙。研究结果可为柑橘的引种、生产布局及栽培管理提供理论依据。

关键词: 柑橘 强冷空气 光合作用 保护酶活性 主成分分析 耐寒性

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不同NFC/NDF日粮对育肥赣西山羊生长性能、肉品质和器官发育的影响

草业科学 2022 北大核心 CSCD

摘要:为了探讨不同非纤维性碳水化合物/中性洗涤纤维(NFC/NDF)日粮对育肥赣西山羊生长性能、肉品质和器官发育的影响,试验选择健康、月龄和体重相近的赣西山羊39只,随机分为3组,每组13只(公7母6).每组山羊分别饲喂NFC/NDF为0.9 (L组)、1.2 (M组)和1.5 (H组)的全价颗粒饲料,试验期为70 d.结果表明:1)试验第40和70天,L组山羊体高显著低于M组(P < 0.05).2)试验1~40 d,H组山羊的平均日采食量和料重比均显著高于M组(P <0.05);试验1~70 d,H组山羊的平均日采食量显著高于L组(P < 0.05).3) L组的山羊肉剪切力显著高于M组(P <0.05),M组的山羊肉黄度显著高于H组(P < 0.05).4) L组山羊瘤胃重量显著高于H组(P < 0.05),H组山羊网胃重量和指数以及皱胃重量和指数极显著低于其他两组(P < 0.01).综上所述,从本研究结果来看,日粮低NFC/NDF能够促进赣西山羊胃的发育,提高生长性能,其中NFC/NDF为0.9日粮对赣西山羊育肥效果较好.

关键词: 全价颗粒饲料 生产性能 体尺指标 中性洗涤纤维 非纤维性碳水化合物

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QuEChERS-超高效液相色谱-串联质谱法测定畜禽毛发中5种违禁药物残留

分析试验室 2022 EI 北大核心 CSCD

摘要:毛发样品采用0.5%乙酸-乙腈提取,经45℃水浴震荡2 h,通过QuEChERS(PLS-A/PSA)分散净化,Agilent ZORBAX SB-Aq色谱柱(3.0 mm×100 mm,1.8 μm)分离,正离子扫描,电喷雾串联质谱多反应监测模式测定,内标法定量.5种违禁药物在0.2~20μg/L范围内线性关系良好(R2>0.997),阿奇霉素和地西泮检出限(LOD)和定量限(LOQ)分别为0.1 μg/kg和0.2 μg/kg,氯霉素、金刚烷胺和利巴韦林检出限和定量限分别为0.2 μg/kg和0.5 μg/kg,回收率范围为84.8%~119.2%,相对标准偏差(RSD)均小于10%.本方法适用于畜禽毛发中5种违禁药物的定性定量分析,可实现对养殖过程的质量安全监管.

关键词: 违禁药物 畜禽毛发 QuEChERS 超高效液相色谱-串联质谱

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利用高密度SNP芯片分析杭猪的群体遗传结构

畜牧兽医学报 2022 北大核心 CSCD

摘要:旨在更好地了解杭猪保种群体的遗传多样性、亲缘关系和家系结构,有效保护和利用杭猪遗传资源。本研究使用50K SNP芯片对30头杭猪(4头公猪,26头母猪)保种个体进行了单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism, SNP)测定,通过Plink软件对获得的基因型数据进行质控,用于最小等位基因频率、观察杂合度、期望杂合度和多态信息含量的计算,分析杭猪保种群的遗传多样性;使用Plink计算连续性纯合片段(runs of homozygosity, ROH)、构建状态同源(identity by state, IBS)距离矩阵,并计算得到基于连续性纯合片段的近交系数;采用Gmatrix软件构建G矩阵,分析杭猪保种群的亲缘关系;使用Mega X软件构建公猪进化树,分析保种群体的家系结构。结果表明,30头杭猪共得到57 466个SNPs标记,平均检出率为0.988 3±0.000 4,通过质检SNPs数为34 156;平均最小等位基因频率为0.228±0.137,平均多态信息含量为0.255±0.098;平均观察杂合度为0.359±0.181,平均期望杂合度为0.314±0.140。杭猪保种群体平均IBS遗传距离为0.241 7±0.033 6,公猪平均IBS遗传距离为0.178 3±0.025 5;G矩阵分析结果与IBS距离矩阵一致,两个结果均表明杭猪保种群部分个体之间亲缘关系较近。30头杭猪个体共检测到828个ROHs, 83.33%的ROH长度在10 Mb以内,平均长度为(6.96±9.62)Mb,个体ROH平均总长度为(191.95±201.56)Mb。基于ROH的平均近交系数为0.078±0.082,其中公猪平均近交系数为0.219±0.082,说明杭猪保种群整体的近交程度不严重,但公猪存在近交。进化树结果表明,杭猪保种群体目前只有2个家系,其中1个家系包含4头公猪,另一个家系不含公猪。综上所述,杭猪保种场的保种群公猪的血缘数量少,母猪近交程度低,公猪存在近交,需要引入新血统或创建新血统来维持家系结构的平衡以利于杭猪遗传资源的长期保存,防止杭猪遗传多样性的丢失。

关键词: 杭猪 SNP芯片 遗传多样性 亲缘关系 家系结构

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山香圆叶提取物对文昌鸡生长性能、血清免疫和抗氧化功能以及肠道微生物的影响

动物营养学报 2022 北大核心 CSCD

摘要:本试验旨在研究饲粮中添加山香圆叶提取物(TFE)对文昌鸡生长性能、血清免疫和抗氧化功能及肠道微生物的影响.选择同批次的42日龄雌性文昌鸡432羽,随机分为4组,每组6个重复,每个重复18羽.对照组饲喂基础饲粮,试验组饲喂在基础饲粮中分别添加0.015%、0.030%、0.060%TFE的试验饲粮,试验期为42 d.结果表明:1)随着饲粮中TFE添加水平的增加,文昌鸡终末体重呈显著线性升高(P<0.05),料重比(F/G)呈显著线性和二次曲线变化(P<0.05).与对照组相比,添加0.030%和0.060%的TFE显著提高了文昌鸡的平均日增重(ADG)(P<0.05).2)随着TFE添加水平的增加,文昌鸡血清总蛋白(TP)、球蛋白(GLB)、白细胞介素-10(IL-10)、白细胞介素-1β(IL-1β)、白细胞介素-6(IL-6)和肿瘤坏死因子-α(TNF-α)含量呈显著线性和二次曲线变化(P<0.05),血清免疫球蛋白M(IgM)含量呈显著线性增加(P<0.05).与对照组相比,添加0.030%和0.060%的TFE显著提高了血清免疫球蛋白A(IgA)和免疫球蛋白G(IgG)含量(P<0.05),显著降低了血清丙二醛(MDA)、IL-6和TNF-α含量;添加0.060%的TFE显著提高了血清总抗氧化能力(T-AOC)、超氧化物歧化酶(SOD)活性和IL-10含量(P<0.05),不同添加水平的TFE均显著提高了文昌鸡血清谷胱甘肽过氧化物酶(GSH-Px)活性(P<0.05),显著降低了血清IL-1β含量(P<0.05).3)随着TFE添加水平的增加,空肠绒毛高度和绒毛高度/隐窝深度呈显著线性和二次曲线变化(P<0.05).4)与对照组相比,添加0.060%的TFE显著降低了盲肠变形菌门相对丰度(P<0.05),显著提高了粪肠杆菌属和乳酸杆菌属的相对丰度(P<0.05).5)通过二次函数拟合,确定TFE最适添加水平为0.056%.综上所述,饲粮中添加TFE能够改善文昌鸡生长性能,提高文昌鸡血清免疫和抗氧化功能,可以通过提高血清抗炎因子含量,降低促炎因子含量,从而缓解机体炎症损伤,改善肠道组织形态,促进肠道对营养物质的吸收.本试验条件下,推荐42~84日龄文昌鸡TFE最适添加水平为0.056%.

关键词: 山香圆叶提取物 文昌鸡 生长性能 免疫和抗氧化功能 肠道微生物

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